Nøgne ø har vunnet mange priser både i inn- og utland siden de for alvor slo igjennom på midten av 2000-tallet. Som bryggeriet sier, de går aldri på kompromiss med kvaliteten og dette har vært med til å skape den suksess de etter hvert har oppnådd i Norge og i den store verden. Fra å være et knøttlite bryggeri med base i Grimstad har de vunnet en plass som den største leverandør av håndverksøl i Norge og de selger produktene sine i mer enn 40 land rundt om i verden. Porteføljen har etter hvert kommet opp på mer enn 40 ulike typer øl, alle produsert på samme måten som i begynnelsen. Her brukes de beste råvarene og prosessen følges med argusøyne fra start til slutt slik at kvaliteten blir så høy som mulig.
At Nøgne ø har hatt suksess med sine produkter fra et tidlig tidspunkt kan blant annet sees ved at de allerede i 2007 ble ranket som det 44. beste bryggeri i verden og det 12. beste i Europa. Det er det kjente nettstedet «RateBeer.com» som står bak rangeringen. Men utover en flott plassering blant de beste bryggeriene i verden, så har de også vunnet flere priser i Norge og i resten av verden.
Prisene begynte å komme etter hvert som de ble mer og mer kjent for sin kvalitet blant folk flest og mediene samtidig begynte å skrive om dem. Et av høydepunktene kom i 2010 da Dagbladet hadde testet 44 ulike ølsorter og Nøgne Ø sin juleøl «God jul» fikk terningkast syv. Her var smakerne fra seg over kvaliteten og måtte sprenge skalaen for første gang. Siden mottok de prisen for «Årets øl 2010» for Nøgne Ø Imperial IPA (#500) og her tok de også tredjeplassen med Nøge Ø Two Captains Double IPA og fjerdeplassen med Nøgne Ø Red Horizon. De ble også kåret til «Årets bryggeri 2010» av de Norske ølklubbers landsforbund (NORØL) og Norbrygg (Norsk hjemmebryggerforening). At Nøgne ø har en høy stjerne blant ølnytere i Norge kan sees på avstemningen om årets bryggeri. Her fikk Nøgne ø hele 46 % av stemmerne, mens andreplassen kun fikk 25 %.
I år har Nøgne ø mottat en pris for Årets tradisjonsøl under arrangementet Det Norske Måltid. Her var det ølet Norsk Høst som vant i finalen hvor motstanderen var Lysefjordens Vestlandskyss og Stjørdalsbryggeriets Okkelberg. Nøgne Ø Norsk Høst er produsert av vann fra Grimstad, gjær fra Voss, ferske granskudd fra Lillesand og malt fra Ringsaker.
Men også i utlandet har mange fått øynene opp for Nøgne Ø sine produkter og ved World Beer Cup i 2008 ble det til gull med ølet Dark Horizon og sølv til bryggeriet sin Porter. I 2010 fikk de prisen for beste mikrobryggeri på Australian Internationel Beer Awards. Siden har det blitt til flere mindre priser og med den økende eksporten av bryggeriet sine produkter er det liten tvil om at forbrukerne liker det de smaker. Derfor har det også nylig fått tre nye priser i det store utland. Under The International Brewing Awards fikk Nøgne Ø American Pale Ale en sølvmedalje, men flere andre av bryggeriets øltyper fikk også priser. Og i Barcelona under Barcelona Beer Awards fikk de en sølv og en bronsemedalje. Det var Nøgne Ø sin Julequad som tok sølvet og Dark Horizon 5 tok bronse.